原来，正常肝脏只含有少量脂肪，约占4%-7%，其中一半是中性脂肪(甘油三酯)，其余是卵磷脂和少量胆固醇。肝脏是合成和利用中性脂肪的主要器官，而不是储存脂肪的地方。肝脏持续含有脂肪酸进入肝脏形成甘油三酯。新合成的甘油三酯以脂蛋白(主要是极低密度脂蛋白VrpL)的形式迅速释放到血液循环中。当肝脏中甘油三酯的合成和运作失去平衡，中性脂肪大量积聚在肝脏中时，就会形成脂肪肝。
腹部肥胖的人容易患脂肪肝，因为腹部周围的脂肪细胞对刺激更敏感，导致从腹部脂肪细胞输送到肝脏的脂肪酸增加。肝脏中的脂肪酸主要合成甘油三酯，除了一些磷脂和胆固醇。新合成的甘油三酯与肝细胞内质网上合成的载脂蛋白结合形成VLDI=-单酸甘油酯，释放到血液中。当肝脏中合成的甘油三酯超过肝脏将甘油三酯转运出肝脏的能力时，或者当极低密度脂蛋白输出受阻时，甘油三酯在肝脏中的积累会导致脂肪肝。
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